真空脫氣機通常用來對果汁進行真空脫氣，以抑制果汁的氧化和褐變。經過脫氣可以同時去除懸浮微粒上附著的氣體，防止微粒上浮，改善產品外觀；減少高溫滅菌和灌裝時起泡，改善殺菌效果，減少容器內部的腐蝕。生產液體奶或含乳飲料也經常進行脫氣。一般真空脫氣是在均質后進行，有時也在灌裝前脫氣,與殺菌機組配套，實現全自動控制。